オプティマスプライムによりサイバトロン星せいへの通路つうろ「スペース・ブリッジ」が破壊はかいされ、正義せいぎのオートボットと悪あくのディセプティコンの戦争せんそうが終おわってから15年ねん。
フィラデルフィアからペンシルベニア州しゅうの小ちいさな町まちウィトウィッキーに引ひっ越こしてきたマルト一家いっかのロビーとモーの兄妹きょうだいは、偶然ぐうぜん入はいった洞窟どうくつで、テランと呼よばれる地球ちきゅう生うまれの新あたらしいトランスフォーマーを誕生たんじょうさせてしまう。
テランのツウィッチとスラッシュの2人ふたりとロビーとモーは手てに付つけられたサイバー・スリーブによって感情かんじょうがつながっていることに気付きづく。そしてテランのふたりはマルト一家いっかの家族かぞくとして生活せいかつを始はじめるのだった。

オプティマスプライムは人間にんげんとトランスフォーマーが平和へいわに暮くらせる世界せかいを目指めざし、ゴーストと呼よばれる秘密組織ひみつそしきで働はたらき、ディセプティコンをとらえていた。そんな中なか、最近さいきんディセプティコンたちが消きえているという噂うわさを耳みみにする。
新あらたな敵てきがウィトウィッキーの町まちに迫せまっていると察知さっちしたオプティマスは、かつて戦争せんそうでともに戦たたかったロビーとモーの母親ははおやドットを訪たずね、ゴーストに協力きょうりょくしてほしいと頼たのむ。

謎なぞに包つつまれたゴースト組織そしき・・・
テランたちが見みつかればつかまってしまう。
そしてトランスフォーマーたちを狙ねらう新あらたな敵てきとはいったい何者なにものなのか。

家族かぞくを、トランスフォーマーたちを守まもるため、みんなで敵てきに立たち向むかう！