物語ものがたりの舞台ぶたいは未知みちなる力ちからを持もつ惑星わくせいエレメントロス。主人公しゅじんこうオプティマスプライムは仲間なかまであるメガトロンを追おい、この地ちに降おり立たつ。その地ちでオプティマスは、エナジービーストであるキリン型がたのトランスフォーマー「ライトロング」と出で会あう。ライトロングによればエレメントロスに住すむ動物どうぶつや恐竜きょうりゅうの姿すがたをしたエナジービーストたちは炎ほのお、水みず、大地だいち、自然しぜん、雷かみなり、5つの属性ぞくせいの力ちから「エレメントエナジー」を秘ひめているという。そんな中なか、突如とつじょ襲おそい来くるメガトロン。オプティマスとライトロングは絆きずなの力ちからで変形合体へんけいがったい【ワイルドッキング】の能力のうりょくを覚醒かくせいさせる。動物どうぶつたちと力ちからを合あわせるオプティマス、恐竜きょうりゅうたちを従したがえるメガトロン。その命運うんめいはいかに───！！